Зоряні війни: Війни клонів - Сезон 1

Магістр джедаїв Йода і троє воїнів-клонів - Джек, Тір і Рис - повинні протистояти жахливій вбивці графа Дуку Вентресс і її величезній армії дроїдів, щоб довести, що джедаї достатньо сильні, щоб захистити стратегічну планету і укласти угоду для Республіки.

Атака новою руйнівною зброєю сепаратистів — могутнім зорельотом «Малеволенс» — змушує майстра-джедая Пло Куна та його клонів боротися за виживання, поки Енакін і Асока не знайдуть їх.

За допомогою своєї падаваньки Асоки та майстра-джедая Пло Куна, Енакін використовує нові далекобійні бомбардувальники Y-wing, щоб очолити сміливий удар по військовому кораблю генерала Грівуса «Малеволенс» та його руйнівній зброї.

Падме Амідала та C-3PO потрапляють у полон до генерала Грівуса, тож Енакін та Обі-Ван мають врятувати сенаторку та завершити знищення «Малеволенса».

Залишившись на самоті на віддаленому аванпості, офіцери-клони Рекс і Коді мають надихнути свій підрозділ новачків повірити в себе, щоб відбити вторгнення дройдів-комуандос.

R2-D2 зникає під час запеклої космічної битви, і Енакін має знайти його раніше, ніж сепаратисти виявлять військові секрети джедаїв, заблоковані в його банках пам'яті.

Енакін, Асока та дройд-замінник R3-S6 вирушають на подвійну місію з порятунку та саботажу, коли дізнаються, що R2-D2 утримують на секретному посту прослуховування ворога генерала Грівуса — станції Скайтоп.

Під час дипломатичної місії на планеті Родія Падме виявляє, що її старий друг і колега-сенатор Республіки Онаконда Фар об'єднав свою планету з сепаратистами. В обмін на їжу та ресурси для свого народу Онаконда захоплює Падме і обіцяє передати її Нуту Ганрею. Відчуваючи, що Падме в біді, Джар Джа Бінкс переодягається джедаєм і за допомогою C-3PO відважно бореться, щоб врятувати свою подругу та колегу-сенаторку.

Асока та майстер-джедай Люмінара супроводжують захопленого відомого лідера сепаратистів Нута Ганрая на Корусант, щоб він міг постати перед судом за свої злочини. Однак вони не знають, що граф Дуку відправив свою вбивцю, Асажж Вентресс, щоб звільнити їхнього полоненого. За допомогою сенаторських командос джедаї мають зірвати спроби Вентресс звільнити в'язня, незважаючи на зрадницькі плани капітана гвардії Сенату Аргіуса.

Майстер-джедай Кіт Фісто та його колишній падаван, джедай мон-каламарі Нахдар Вебб, вистежують втікача Нута Ганрая на віддаленому світі. Слідуючи за Нутом у таємниче лігво, заповнене дивними істотами, зброєю та військовими артефактами, джедаї виявляють, що це сповнене пасток сховище генерала Грівуса! Дізнавшись, що граф Дуку заманив сюди джедаїв, щоб покарати Грівуса за його нещодавні невдачі, генерал вирішує довести свої здібності та знищити джедаїв. Кіт і Нахдар разом із загоном клонів тепер повинні пробитися крізь Грівуса та його дроида-опікуна A-4D, щоб назавжди не опинитися в злих пазурах генерала.

Під час власної спроби викрасти графа Дуку, Енакін та Обі-Ван виявляють, що лорд ситхів уже був захоплений піратами. Хондо Онака та його банда піратів тримають Дуку в полоні у своєму лігві на Флорумі та вимагають за нього викуп. Тепер Енакіну та Обі-Вану належить з'ясувати, чи не є ця пропозиція занадто привабливою, щоб бути правдою.

Енакіна та Обі-Вана обдурили, і тепер вони разом із графом Дуку перебувають у полоні у ватажка піратів Хондо Онаки та його заступника Турка Фальсо, які вимагають викуп. Поки Енакін, Обі-Ван і Дуку безуспішно намагаються втекти, Республіка надсилає викуп через спеціального посланця, зокрема представника Джар Джа Бінкса. Коли Фальсо намагається вкрасти викуп у свого боса, збивши шаттл, єдиними вцілілими стають загін клонів і Джар Джа, який як найстарший живий офіцер має взяти керівництво місією на себе. Починається гонка з часом, адже Джар Джа поспішає доставити викуп, щоб забрати Дуку та врятувати джедаїв.

Енакін та Асока прибувають у розпал повітряної битви, щоб допомогти оточеному генералу-джедаю Айле Секурі. Енакін отримує важке поранення в бою. Айла та Асока разом із пораненим Енакіном, Рексом та клонами, що вижили, здійснюють аварійну посадку на невідомій вкритій травою планеті Марідун. Будучи змушеними залишити Енакіна, щоб врятувати його, Айла пояснює Асоці, чому джедаї не мають особистих прив'язаностей. Вони прямують до селища лурменів. Їхній правитель, Ті Ватт Ка, пояснює, що вони є пацифістами в цій війні і не підтримують жодну зі сторін. Попри небажання мати щось спільне з джедаями, Ті Ватт Ка погоджується допомогти врятувати життя Енакіна.

Лідер лурменів, Ті Ватт Ка, відмовляється надати притулок джедаям перед прибуттям сил сепаратистів, побоюючись, що така дія неоправдано втягне його нейтральний народ у війну. Асока, Айла, поранений Енакін та решта клонів поважають їхнє бажання, оскільки не хочуть ставити під загрозу селище своєю присутністю, тому вони змушені відступити в дикі землі планети. Прибуває сепаратистський наймоїдський генерал Лок Дурд, щоб випробувати руйнівну зброю, яку вони планують використати проти лурменів! Зрештою, жителям селища доведеться вирішити, чи підкоряться вони сепаратистам, чи будуть битися разом із джедаями, щоб захистити своє селище.

Прибувши на пустельний крижаний світ Орто Плутонія, Енакін Скайвокер та Обі-Ван Кенобі розслідують зникнення загону клонів-охоронців, що був розміщений на віддаленому аванпості. Джедаї в супроводі сенаторки Рійо Чучі та голови Чо з сусіднього місяця Пантора незабаром виявляють, що на їхніх клонів напало плем'я волохатих аборигенів, відомих як тальзи. Люті воїни, що їздять на звірах, тальзи дуже територіальні і хочуть лише, щоб їх залишили в спокої. Джедаї спромоглися домовитися про мир із вождем тальзів Ті-Сеном, але жадібний голова Чо порушує його, наполягаючи, що планета і тальзи перебувають під його владою. Конфлікт, що виникає, переростає у війну між клонами під керівництвом сенаторки та тальзами, а джедаї опиняються посередині.

Енакін Скайвокер та Обі-Ван Кенобі очолюють сили Республіки в спробі перемогти армії дройдів і звільнити планету Крістофсіс від сепаратистської облоги. Коли Республіка потрапляє в засідку і змушена відступити, стає зрозуміло, що хтось серед них їх зрадив. Джедаї вважають, що це проникнення є операцією, підтриманою ситхами, і вирушають у тил ворога для розслідування. Тим часом капітан Рекс і командувач Коді намагаються викрити зрадника серед своїх.

Республіка виявляє секретну лабораторію біологічної зброї сепаратистів на планеті Набу. Замість того, щоб чекати на допомогу, Падме разом із Джар Джа досліджує лабораторію. Енакін, Асока, Рекс та Обі-Ван прибувають і слідують за нею. Вони виявляють, що сенаторку тримає в полоні зловісний доктор Нуво Вінді. Божевільний вчений розробляв смертоносний вірус для сепаратистів. Вінді погрожує підірвати бомбу і вивільнити вірус!

Попри те, що лабораторію закрито, доктору Вінді вдається активувати жахливий вірус Блакитної Тіні, заразивши Асоку, Падме та багатьох клонів. Хвороба стає смертельною протягом 48 годин. Енакін та Обі-Ван повинні вирушити на таємничу планету Іего, щоб дістати єдину відому протиотруту від цієї хвороби. Прибувши на загадкову планету, Енакін та Обі-Ван виявляють, що її населення живе в страху перед таємничою силою, яка вбиває кожного, хто намагається залишити цей світ. За допомогою Джейбо Худа, кмітливого хлопчика з Іего, Енакін та Обі-Ван мають розгадати таємницю планети, перш ніж вони зможуть поїхати, і до того, як усі заражені сепаратистським вірусом помруть!

Райлот, рідна планета тві'леків, опинився під військовою окупацією дройдів-сепаратистів і був оточений блокадою лінкорів Торгової Федерації. Під час раптової атаки на блокаду Асока нехтує наказами Енакіна і в результаті втрачає більшість свого ескадрену. Попри те, що ця невдача сильно засмучує її, Енакін допомагає їй навчитися бути стійкою, довіривши їй керівництво ще однією ризикованою атакою.

Після знищення космічної блокади навколо Райлота Обі-Ван Кенобі має очолити невеликий загін клонів у місті, окупованому дройдами, щоб вивести з ладу їхні зенітні установки. Місія Обі-Вана ускладнюється, коли він дізнається, що жителів міста використовують як живі щити. Двоє клонів із його взводу зав'язують незвичайну дружбу з дівчинкою-тві'леком Нумою, яка стала сиротою через війну. Через стосунки з нею клони починають усвідомлювати справжню ціну війни.

Битва за рідну планету тві'леків Райлот розгорається, поки Республіка намагається вибити окупаційну армію дройдів на чолі з лідером сепаратистів Ватом Тамбором. Оскільки його сили розпорошені, Мейс Вінду має переконати борця за свободу тві'леків Чама Сіндуллу допомогти йому врятувати столицю від руйнування дройдами. Спочатку герой-тві'лек вагається, чи варто допомагати Мейсу, але зрештою розуміє, що джедаям можна довіряти, і об'єднується з ним, щоб звільнити місто — а зрештою і всю планету — у вирішальній битві.

Намагаючись змусити звільнити з в'язниці кримінального авторитета Зіро Хатта, мисливці за головами захоплюють будівлю Сенату і беруть членів Сенату в заручники. Кед Бейн, керівник операції, за допомогою мисливиці за головами Аури Сінг висуває свої вимоги канцлеру Палпатину, який не має іншого вибору, окрім як погодитися. Мисливці не знають, що в будівлі Сенату вже діє лицар-джедай Енакін Скайвокер.